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Sclérochronologie  

Image-Pro Premier met à la disposition des biologistes du domaine de la pêche, une série d'outils d'analyse d'images pour détecter, identifier et mesurer de façon précise les anneaux de croissance.

Les mesures subjectives sont maintenant remplacées par des critères objectifs et précis pour analyser et comparer les données.


Analyse d'otolithes et détection des anneaux de croissance avec le logiciel Image-Pro

 

Sclérochronologie Image-Pro

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Détection automatique des anneaux de croissance réalisée à l'aide du logiciel Image-Pro Premier

Détection et mesure précise des otolithes

L'expérience montre que l'automatisation des méthodes de mesure permet d'obtenir des résultats beaucoup plus fiables et précis. Ceci est particulièrement vrai lorsque l'on a besoin de plusieurs mesures sur un grand nombre d'échantillons. L'analyse d'otolithes de poissons correspond exactement à ce type d'application. Les cernes sombres sur les otolithes sont facilement détectés et mesurés à l'aide des outils numériques. L'enregistrement des mesures, de l'emplacement et de la distance entre les anneaux est grandement simplifié par les outils automatiques mis à disposition par le logiciel.

Acquisition de grandes images à l'aide du Live Tiling et Live EDF

Possibilité d'acquérir et d'assembler vos images en vous déplaçant au-dessus de votre échantillon. Création automatique de mosaïques d'images. Le module Tiling combiné avec le module EDF assure la netteté de l'image en combinant les différentes profondeurs de plan focal.

 

Calibration de l'image pour obtenir des mesures dans les unités désirées

Image-Pro Premier permet de créer, enregistrer et réutiliser vos propres calibrations lors de vos analyses d'otolithes. Des calibrations standards peuvent être directement créées à partir des différents grandissements disponibles sur votre matériel optique.

Outil de profil de ligne pour identifier la position des anneaux de croissance

L'outil de profil de ligne permet de créer un profil d'intensité en fonction de la position et de l'amplitude des anneaux de croissance à analyser. Image-Pro donne la possibilité de choisir entre un marquage manuel ou une détection automatique de ces anneaux.

 

Zoom sur les régions d'intérêt pour modifier le placement des anneaux détectés

Les outils de zoom permettent de centrer les agrandissements sur les pics à détecter. Possibilité d'ajuster manuellement les marqueurs de mesure des anneaux de croissance générés par la détection automatique. Les cernes apparaissent comme des pics sur le profil de ligne.

 

Mesure de distance entre les anneaux de croissance

Une fois les marqueurs mis en place, leurs positions peuvent être éditées dans un formulaire. Une option permet alors de générer les distances entre les anneaux de croissance.

 

Exportation des données

Les résultats peuvent directement être exportés vers Excel ou sauvegardés sous forme de fichiers facilement importables dans d'autres logiciels. Possibilité de réaliser et de sauvegarder facilement des screenshots de vos travaux et de les intégrer dans des rapports pré formatés.

 

Bibliographie et références

Ceci est un échantillon des nombreuses publications qui font référence au logiciel Image-Pro:

 
Titre Journal Auteurs Article
Otolith Research Laboratory - Bedford Institute of Oceanography Laboratory Dr Steven E Campana Link
Temperature effects on otolith pattern formation in Atlantic cod Gadus morhua Journal of Fish Biology  F. C. Neat, P. J. Wright, R. J. Fryer Abstract
Comparison of otolith growth and morphology with somatic growth and age in young-of-the-year bluefin tuna Journal of Fish Biology  P. Megalofonou Abstract
Validation of otolith growth rate analysis using cadmium-exposed larval topsmelt (Atherinops affinis) Environmental Toxicology and Chemistry Wendy L. Rose, James A. Hobbs, Roger M. Nisbet, Peter G. Green Abstract
Environmental influences on the relationship
between juvenile and larval growth of Atlantic
croaker Micropogonias undulatus
Marine Ecology Progress Series Steven P. Searcy, David B. Eggleston, Jonathan A. Hare Article PDF
Early life history of the black anglerfish Lophius budegassa Spinola, 1807 in the Mediterranean Sea using otolith microstructure Fisheries Research Mario La Mesa, Francesca De Rossi Abstract
Thyroid hormones are necessary for the metamorphosis of tarpon Megalops cyprinoides leptocephali Journal of Experimental Marine Biology and Ecology Jen-Chieh Shiao, Pung-Pung Hwang  Abstract
Combined methods of otolith shape analysis improve identification of spawning areas of Atlantic cod ICES Journal of Marine Science Elizabeth A. Galley, Peter J. Wright, and Fiona M. Gibb Abstract
Age, Growth, and Mortality of Introduced Flathead Catfish in Atlantic Rivers and a Review of Other Populations North American Journal of Fisheries Management Thomas J. Kwak, D. Scott Waters & William E. Pine III Abstract